O Instituto Soroterápico Municipal no Rio de Janeiro começou a funcionar em 1900. Vasconcellos, então assistente do Instituto Vacínico (criado na fazenda de Manguinhos pelo Barão de Pedro Affonso em 1889), foi um dos três profissionais a integrar o corpo técnico do novo órgão.
Com a transferência para a Diretoria de Saúde Pública, a instituição tornou-se Instituto Soroterápico Federal. Dos três profissionais do quadro original Vasconcellos foi o único a permanecer. Participava da preparação do soro e da vacina contra peste.
Indicado por Oswaldo Cruz substitui-o na Diretoria Geral de Saúde Pública, de onde se demitiu por ser contrário à redução constante das verbas para a saúde pública.
Formado bacteriologista no próprio IOC e no Instituto Pasteur de Paris, foi o responsável pelos primeiros estudos de micologia médica em Manguinhos